南京大学医学院附属口腔医院（南京市口腔医院）儿童口腔科成立于1993年,自成立以来，科室发展迅速，现已成为江苏省规模较大、年门诊量较多的儿童口腔专科，现为中华口腔医学儿童口腔医学专委会常委单位、南京市医学临床重点专科。儿童口腔科设置于医院门诊六楼，诊室装修充分考虑了儿童的特征，增加了一些卡通因素，显著减轻了患儿就诊时的牙科畏惧及焦虑情绪。

科室现有医师22人，其中主任医师4名、副主任医师6名，硕士及以上学历人员18人，中华口腔医学会儿童口腔专业委员会常委、委员、青年委员各1人。医务人员具有扎实的专业知识、丰富的临床经验和规范的操作技能，是一支结构合理、业务能力较强、专科特色明显的队伍。科室多次举办国家级及省级继续教育学习班，承担着南京大学医学院口腔专业硕士研究生、本科生教学任务，同时也是国家级住院医师儿童口腔规范化培训基地。

科室能正常开展三级甲等口腔专科医院所要求的技术项目。一般技术项目有：乳牙根管治疗、龋病充填术、盖髓术、年轻恒牙活髓切断术、乳、恒牙前牙外伤诊断和处置、恒牙根管治疗术、乳牙拔除术、涂氟、窝沟封闭术。重点技术项目有：年轻恒牙根尖诱导形成术，乳牙早失的间隙管理，咬牙合诱导、年轻恒牙根尖诱导术、埋伏多生牙的拔除术。科室同时注重临床新技术的开发与应用，开展多项新技术，如：年轻恒前牙外伤冠折的断冠再接术、混合牙列期畸形的早期固定矫治、MRC矫治、MTA根尖屏障术、埋伏阻生牙的正畸牵引术、乳牙预成冠的修复、年轻恒牙血运重建术，受到患儿家长的广泛好评。